Driver, 
Первое, что приходит на ум (более подробно- надо рисовать схемы и просто экспериментировать)
1. Независимый источник питания сигналки.
2. Дублирующие концевики, там где их угонщики не смогут заблокировать.
3. Отказ от мигающих фонарей или включение в их цепь предохранителей, исключающих подыхание сигналки от КЗ
4. Электроманитный клапан на подаче топлива, закрывающийся при подаче сигнала или при обесточивании автомобиля (также полезно в плане противопожарной безопасности).
5. Скрытые реле на цепи зажигания, на цепи ТНВД для впрысковых автомобилях.
Могу еще придумать 
 
Как КИПовец могу сказать, что места для фантазии в электросхеме современного автомобиля всегда есть. Лично мне мешает врожденная лень  

 , отсутствие опыта работы с автомобильными цепями и невысокая популярность простых Нив у угонщиков. 
Согласен, что про неугоняемый автомобиль я загнул, так как для этих систем я так же смогу придумать обходные пути, но угонщики, насколько я понимаю их работу, ковыряться не любят  
